Protein–RNA interactions for Protein: F6VLK5

Gm10722, Predicted gene 10722, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10722F6VLK5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10722F6VLK5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms