Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp988F6VKC7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp988F6VKC7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp988F6VKC7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp988F6VKC7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp988F6VKC7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zfp988F6VKC7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Zfp988F6VKC7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp988F6VKC7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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