Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6619F6URP1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6619F6URP1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms