Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms