Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp17lbE9Q9U0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp17lbE9Q9U0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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