Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aknad1E9Q8N6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aknad1E9Q8N6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aknad1E9Q8N6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aknad1E9Q8N6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aknad1E9Q8N6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aknad1E9Q8N6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aknad1E9Q8N6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms