Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtproE9Q612 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms