Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms