Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Susd1E9Q3H4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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