Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd2E9Q3C1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms