Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Vmn1r68E9Q0V3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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