Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms