Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx60E9PZQ1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms