Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms