Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms