Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gcn1E9PVA8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms