Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp839E9PUU5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms