Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms