Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms