Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms