Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm20521D3Z5F7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20521D3Z5F7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms