Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms