Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1500009C09RikD3YYW9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms