Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms