Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms