Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2d4D3YUH6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms