Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clip3B9EHT4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms