Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Phf11cB4XVP9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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