Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cfap58B2RW38 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cfap58B2RW38 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms