Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Prrt4B2RU40 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Prrt4B2RU40 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Prrt4B2RU40 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrt4B2RU40 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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