Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol7aB2RT54 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms