Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms