Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms