Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms