Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms