Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms