Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms