Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms