Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf39A2RT81 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf39A2RT81 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf39A2RT81 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf39A2RT81 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf39A2RT81 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf39A2RT81 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf39A2RT81 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rnf39A2RT81 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf39A2RT81 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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