Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2al1jA2BFR3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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