Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1A2ANU3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms