Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc39aA2ACP1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ttc39aA2ACP1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39aA2ACP1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ttc39aA2ACP1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc39aA2ACP1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc39aA2ACP1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc39aA2ACP1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39aA2ACP1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms