Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8nlA2ABX0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms