Protein–RNA interactions for Protein: A2ABG4

Tbc1d16, TBC1 domain family, member 16, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d16A2ABG4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbc1d16A2ABG4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbc1d16A2ABG4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbc1d16A2ABG4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbc1d16A2ABG4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbc1d16A2ABG4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbc1d16A2ABG4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbc1d16A2ABG4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tbc1d16A2ABG4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tbc1d16A2ABG4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d16A2ABG4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms