Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm16A2A935 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm16A2A935 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms