Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb4A2A863 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms