Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdc27A2A6Q5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms