Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRT9

Gm28490, Predicted gene 28490, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28490A0A087WRT9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm28490A0A087WRT9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm28490A0A087WRT9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm28490A0A087WRT9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm28490A0A087WRT9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm28490A0A087WRT9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm28490A0A087WRT9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm28490A0A087WRT9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28490A0A087WRT9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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