Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm5114W4VSN8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm5114W4VSN8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm5114W4VSN8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms