Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Homer1Q9Z2Y3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Homer1Q9Z2Y3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Homer1Q9Z2Y3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms